答案：C

题目分析：本题主要考查学生对基础知识的准确识记能力，比较简单。根据所学知识，清朝于1684年设立台湾府,隶属福建省,后于1885年设立台湾行省，A项是错误的；清朝顺治皇帝于公元1653年的册封，达赖喇嘛这一封号就成为达赖系统的专用名称，公元1713年，清朝康熙皇帝册封班禅时的正式封号是“班禅额尔德尼”，B项是错误的；收复雅克萨时，康熙帝没有御驾亲征，D项是错误的；康熙第一次南巡到曲阜时,曾向孔庙行三跪九叩之礼,亲书“万世师表”悬于大成殿上，C项是正确的。所以答案选C。