A、木柴燃烧是一种化学变化，即是将化学能转化为内能，故不符合题意；

B、在阳光照射下，水的温度升高，这是通过热传递改变物体的内能，故不符合题意；

C、高速飞行的子弹发热，即子弹与空气摩擦力，使得其内能增加，温度升高，所以是通过做功改变内能的，故符合题意；

D、烧水时水蒸气顶起壶盖，即该过程中消耗内能，产生机械能，故是将内能转化为机械能的过程，故是做功改变内能，但内能减小，故不符合题意；

故选C．