A、千克、秒分别是质量和时间的单位，是国际单位制中的基本单位，但牛顿是导出单位，所以A错误．

B、千克、米、秒分别是质量、长度和时间的单位，都是国际单位制中的基本单位，所以B正确．

C、秒是时间的单位，是国际单位制中的基本单位，但克和千米不是国际单位制中的基本单位，所以C错误．

D、米是长度的单位，是国际单位制中的基本单位，但牛顿和克不是国际单位制中的基本单位，所以D错误．

故选B．