参考答案：甲、乙、丙依然应将争议交由北京仲裁委员会仲裁，因为合同的无效并不影响到争议解决条款的效力。

解析：[考点] 仲裁条款的效力
《仲裁法》第16条规定了有效仲裁条款的要件：仲裁协议包括合同中订立的仲裁条款和以其他书面方式在纠纷发生前或者纠纷发生后达成的请求仲裁的协议。仲裁协议应当具有下列内容：(1)请求仲裁的意思表示；(2)仲裁事项；(3)选定的仲裁委员会。
本题中，甲公司、乙公司、丙公司约定将争议交由北京仲裁委员会仲裁，各方具有请求仲裁的意思表示，且仲裁事项和仲裁委员会确定，是有效仲裁。
另外，仲裁条款具有独立性， 《仲裁法》第19条第1款规定：仲裁协议独立存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。因此，虽然合同因为违反法律的禁止性规定而被宣告无效，但甲公司、乙公司、丙公司发生争议后，依然应将争议交由贸易仲裁委员会仲裁。