参考答案：D

解析：

费用的缴纳期限

根据<专利法实施细则》第95条的规定，选项A、B、C的缴纳期限和申请费相同，故选项A、B、C错误。

《专利法》第35条规定：“发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查；申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。国务院专利行政部门认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。”《专利法实施细则》第96条的规定，以及《专利审查指南2010》1-1-6.4.1“实质审查请求的相关要求”中进一步规定：“实质审查请求应当在自申请日(有优先权的，指优先权日)起三年内提出，并在此期限内缴纳实质审查费。”实质审查费的缴纳期限和申请费不同，故选项D正确。