参考答案：(1)张某有权申请李某失踪，因为他是利害关系人。《民法通则》第20条规定，公民下落不明满2年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告他为失踪人。《民通意见》第24条规定，申请宣告失踪的利害关系人，包括被申请宣告失踪人的配偶、父母、子女、兄弟姐妹、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女以及其他与被申请人有民事权利义务关系的人。张某作为被申请人李某的债权人，和李某有民事权利义务关系。因此有权申请李某失踪。
(2)法院的做法是合法的。根据民法通则和民通意见，有权申请公民失踪的利害关系人没有先后顺序，只要其中有人提出申请且满足宣告失踪的实质条件，即使其他利害关系人反对，人民法院仍然应当作出失踪宣告。
(3)法院应指定王某为李某的财产代管人。《民通意见》第30条规定，指定失踪人的财产代管人，应遵循对失踪人财产有利的原则。李某之妻丁某将家中财物转移到姘夫家中，显然不利于李某财产的管理，故不应由其代管，而应由李某之母王某代管。