A、He与H都具有1个电子层，但He最外层电子数为2，H原子最外层电子数为1，故A错误；

B、F^-与Mg²⁺都具有2个电子层，且最外层电子数为8，即具有相同的电子层数和最外层电子数，故B正确；

C、Cl^-和Cl都具有3个电子层，但氯离子最外层电子数为8，而氯原子的最外层电子数为7，故C错误；

D、Al³⁺和Ar的最外层电子数都是8，但铝离子有2个电子层，氩有3个电子层，故D错误；

故选B．