答案：B

题目分析：我国原始农耕生活是从河姆渡居民和半坡原始居民开始的，河姆渡原始居民生活在长江流域、雨量充沛，适合水稻种植，长江流域气候丝润，因此他们住着干栏式房屋；半坡原始居民生活在黄河流域、北方天气寒冷，不适合水稻生长，只能种粟，他们居住半地穴式房屋起到了保暖的作用。因此可以说造成这些差异的主要原因是自然条件的不同。故选B项。

点评：本题难度适中，考查学生的理解能力。通过比较可以发现两者相同的是都进入母系氏族公社的繁荣阶段;都已进入原始农耕时期;普遍使用磨制石器进入新石器时代，不同的是种植农作物和构建的房屋不同，这是由地域和环境的差异造成。