（1）半地穴式房屋；（2）河姆渡原始居民；（3）主要因素：自然环境（或自然因素等）的不同。

题目分析：第（1）问，主要考查学生对原始居民相关史实的准确识记，联系已学知识可知图一是半地穴式房屋，半坡居民住在半地穴式房屋里，屋内由灶炕，供饮煮和取暖用。

第（2）问，主要考查河姆渡军民活动的准确认识，分析图片可以得出图二是干栏式房子，联系已学知识可知河姆渡原始居民居住在干栏式的房子，过着定居的生活。

第（3）问，主要考查学生对分析与理解归纳的能力，回顾已学知识可知河姆渡原始居民生活在今天的浙江余姚，而半坡原始居民生活在陕西西安，结合两个地方的分析可知两种不同房屋结构的主要因素与自然环境有关。