A、在原子中，核内所含的质子数等于其核外电子数，故A错误；

B、在分子中，核内所含的质子数等于其核外电子数，故B错误；

C、阳离子是原子失去电子形成的，所以核内所含的质子数多于其核外电子数，故C正确；

D、阴离子是原子得到，电子形成的，所以核内所含的质子数小于其核外电子数，故D错误．

故选C．