第一题：案件调查（15分）A市烟草专卖局接到群众举报称，本地某商贸有限公司销售非法生产的烟草专卖品。A市烟草专卖局执法人员随即对该公司卷烟经营情况进行检查，查获了部分非法生产的烟草专卖品。经对该公司法定代表人询问，该公司还有重大违法嫌疑，需要进一步调查。A市烟草专卖局决定对公司账证及有关资料进行检查核实，彻底查清其违法行为。在查账过程中，发现某些账务往来不明，遂委托乙会计师事务所进行了会计鉴定。请根据以上案例回答下列问题：

对该公司运用会计鉴定的方式进行调查时，应注意哪些事项？（4分）