答案：C

A、因质子在原子核内，在反应中不会变化，则Cl^-和Cl两种粒子的质子数相同，说法正确；

B、因Cl原子的最外层电子数为7，Cl^-的最外层电子数为8，则它们的核外电子数不相同，说法正确；

C、Cl^-和Cl两种粒子的电子层数都是3，即电子层数相同，说法不正确；

D、因分子、原子、离子都是构成物质的粒子，则Cl^-和Cl两种粒子都是构成物质的粒子，说法正确；

故选C．