A、三种晶体都为原子晶体，原子晶体熔沸点的高低与共价键的强弱有关．一般来说，半径越小形成共价键的键长越短，键能就越大，晶体的熔沸点也就越高，原子半径大小顺序为

Si＞C＞O，熔沸点高低顺序为：金刚石＞石英砂＞硅，故A错误；

B、三种晶体都为离子晶体，离子的半径越小，则离子键越强，熔沸点越高，正确顺序应为：NaCl＞KCl＞CsCl，故B错误；

C、三种晶体中，SiO₂为原子晶体，熔沸点最高，CO₂为分子晶体，CO₂熔沸点最低，正确顺序为：SiO₂＞Hg＞CO₂，故C错误．

D、H₂O和NH₃都存在氢键，熔沸点高于氢气，但O的原子半径比N原子半径小，非金属性更强，H₂O分子间的氢键作用力更强，故D正确．

故选D．