参考答案：A

解析：

本题考核的知识点与海关行政处罚的形式及具体内容相关。根据《海关行政处罚实施条例》的规定，违反《海关法》及其他有关法律、行政法规，逃避海关监管，偷逃应纳税款，逃避国家有关进出境的禁止性或者限制性管理，并有《海关行政处罚实施条例》第七条所列行为之一的是走私行为；而海关管理相对人在从事运输工具、货物、物品的进出境活动或从事海关监管货物的运输、储存、加工、装配、寄售、展示等业务活动中，违反《海关法》及其他有关法律、行政法规的规定，且未构成走私的行为是违反海关监管规定的行为。走私行为和违规行为。这是两类性质完全不同的行为，在是否主观故意、客观行为、行为危害结果等方面有着本质的不同。

根据本题所述案例，经黄岛海关立案调查已认定豫农公司申报不实，但并非主观故意，应按“违反海关监管规定的行为”定性，并按《海关行政处罚实施条例》第十三条“违反国家进出口管理规定，进出口国家禁止进出口的货物的，责令退运，处100万元以下罚款”的规定给予处罚。

故本题正确选项应为A。