答案：A

题目分析：①干冰晶体属于分子晶体，由二氧化碳分子构成的；②二氧化硅是原子晶体，由C、O原子直接构成的；③水蒸气是以水分子构成构成的；④金刚石属于原子晶体，由C原子直接构成的；⑤单晶硅属于原子晶体，由Si原子直接构成的；⑥白磷属于分子晶体，由P₄分子构成的；⑦硫磺分子晶体，由分子构成的；⑧液氨可以形成分子晶体，由分子构成的；⑨钠属于金属晶体，由金属阳离子Na⁺和自由电子构成构成的；氖晶体属于分子晶体，是单原子分子，由氖原子构成的，是以由原子直接构成的物质有②④⑤，答案选A。