参考答案：B

解析：

设有科技机构的企业的数量=企业总数×设有科技机构企业的比重。通过观察，2004年数据肯定低于2003年，2007年数据肯定低于2006年。只要比较2004-2006年的数据即可，2004年的是21776×28.4%=6184，2005年为22904×26.2%=6000，2006年为23096×25.3%=5843，说明设有科技机构的企业数量是一直下降的，所以选B。