A、水由口进入然后经鳃盖后缘流出，当水流经鳃丝时，水中的溶解氧进入鳃丝的血管中，而二氧化碳由鳃丝排放到水中，二者进行气体交换，为正确项．

B、鱼不停地用口吞水，再从鳃孔排水的意义是进行气体交换不是排出废物，为错误项．

C、主要是使水中的溶解氧进入鳃丝的血管中，而二氧化碳由鳃丝排放到水中，进行气体交换，为错误项．

D、鱼不停地用口吞水的目的是进行气体交换而不是摄取食物，为错误项．

故选：A．