答案：B

题目分析：元素是具有相同核电荷数（或质子数）的同一类原子的总称，故决定元素的种类的是核电荷数（或质子数），所以钙元素和铜元素的本质区别在于核电荷数（或质子数）不同。故选B

点评：本题较简单，理解元素的概念是解题的关键，即不同种元素之间的本质区别是质子数不同。