A．新疆的云量少、光照强，有利于生物的光合作用，是瓜果甜的一个主要因素，故不符合题意；

B．新疆的气温昼夜温差大，作物消耗养料少，有利于瓜果和糖料作物的糖分积累，是瓜果甜的本质原因之一，故符合题意；

C．瓜果甜的主要原因不是因降水少，导致瓜果含水量少，糖分高，本质原因是这一地区气候干旱，日照时数多，太阳辐射强，热量丰富，气温昼夜温差大，故不符合题意；

D．新疆瓜果甜的本质原因是日照时数多，太阳辐射强，气温昼夜温差大，有利于瓜果和糖料作物的糖分积累，故不符合题意；

故选：B．