答案：C

题目分析：A、离子化合物中不一定含有金属元素，例如氯化铵等铵盐，A不正确；B、构成分子晶体的微粒中不一定含有共价键，例如稀有气体分子形成的分子晶体，B不正确；C、原子间通过共价键形成的空间网状结构的晶体是原子晶体，所以原子晶体熔化要破坏共价键，C正确；D、并非只有离子化合物中才存在离子，例如金属晶体中存在金属阳离子，D不正确，答案选C。