参考答案：(1)新生隐球菌的主要致病物质是荚膜多糖。
(2)新生隐球菌一般为外源性感染，主要的入侵部位是肺，大部分感染者症状不明显，且能自愈。
(3)新生隐球菌也可以从肺部经血行播散至其他部位，最易侵犯中枢神经系统，主要引起脑膜的亚急性和慢性感染，死亡率高，尚可播散至皮肤、黏膜、骨和内脏器官等。