参考答案：D

解析：

选项A，因自然灾害损失的产品所耗用的进项税可以抵扣，因管理不善造成损失产品的进项税不可以抵扣；

选项B，同时用于应税项目和非应税项目的固定资产的进项税可以抵扣，只用于非应税项目的固定资产进项税不可以抵扣；

选项C，该经营模式下可以抵扣进项税；选项D，纳税人经税务机关核准恢复抵扣进项税额资格后，其在停止抵扣进项税额期间发生的全部进项税额不得抵扣。