X、Y、Z均为短周期元素，Z的阴离子比X的阳离子多三个电子层，则X为氢元素，Z处于第三周期，为非金属，Z的原子最外层电子数为奇数，则Z为磷元素（或氯元素）；Z的原子序数等于X、Y的原子序数之和，则Y为硅元素（或硫元素）．

A、由上述分析可知，Y与Z处于同一周期，原子序数Y＜Z，同周期随原子序数增大，原子半径减小，所以原子半径Y＞Z，故A正确；

B、X为氢元素，属于非金属，故B错误；

C、短周期元素，Z形成阴离子，为非金属，Z为磷元素（或氯元素），故C正确；

D、Z为磷元素（或氯元素），有三个电子层，故D正确．

故选：B．