参考答案：B, C

解析：

《刑事诉讼法》第18条规定：“刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。贪污贿赂犯罪，国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查的侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪，由人民检察院立案侦查。……”

根据《刑法》的规定，非法拘禁罪、非法搜查罪的犯罪主体是一般主体，并不一定是国家机关工作人员，因此，非法拘禁案件、非法搜查案件并不必然由人民检察院立案侦查。报复陷害罪的犯罪主体是国家机关工作人员，刑讯逼供罪的犯罪主体是司法工作人员，属于国家机关工作人员，因此，刑讯逼供案件、报复陷害案件必然是由国家机关工作人员实施的，也必然由人民检察院直接立案侦查。B、C两项正确。