广州市白云区的瑞尔商店2006年9月1日领取营业执照开业，主要零售影碟。同年12月31日经税务机关检查：瑞尔商店未按规定办理税务登记，成本费用记录较真实，共计24万元，但账簿设置不健全，收入总额无法核实。　　根据会计法规和税收征管法规回答下列问题：　　（1）瑞尔商店是合法经营吗？请说明理由。　　（2）瑞尔商店应在什么时间到哪个部门申报办理税务登记？　　（3）税务机关实行核定应税所得率征收办法核定瑞尔商店的所得税，设应税所得率为20%，计算瑞尔商店2006年度应纳税所得额、应纳所得税额（适用所得税率25%）。