A、分子、原子、离子都可以构成物质，分子是其中的一种；故A说法错误；

B、水是由水分子构成的，故保持水的化学性质的最小微粒是水分子，故B说法正确；

C、分子和原子的区别是在化学变化中分子可以再分，而原子不可以再分，一定要强调在化学变化中这个条件，故C说法错误；

D、分子是保持物质化学性质的最小粒子，不能保持物质的物理性质，故D说法错误；

故选B．