参考答案：1．神华集团应办理土地使用权抵押权变更登记。
2．该土地使用权抵押权变更登记的申请程序为：
(1)申请人为神华集团和银行。
(2)应提交的权属证明文件有：
①原抵押合同；
②原《国有土地使用证》或《集体土地使用证》、《土地他项权利证明书》；
③变更后的抵押合同及有关批准文件；
④主合同、土地使用权抵押合同及该集团董事会同意抵押该土地的证明；
⑤土地估价报告及备案资料；
⑥该集团法人证明、法人代表身份证明及身份证；
⑦委托代理公司的还应提交委托代理书、代理合同、代理公司法人营业执照、代理人身份证明及代理人执业资格证书；
⑧其他应该提交的资料及证明。
(3)权属审核：
①对申请人的审核；
②对土地使用权的审核；
③对抵押期限的审核；
④对抵押贷款额的审核；
⑤审核该地是部分抵押、全部抵押或多次抵押；
⑥抵押合同变更的内容应符合国家的有关规定。
(4)注册登记：
①在土地登记卡上填写本次抵押登记的情况；
②在土地证书记事栏填写土地抵押情况；
③填写土地他项权利证书发给该银行。