参考答案：

解析：1．确定A、B单位共有土地使用权。
理由：《确定土地所有权、使用权若干规定》第39条规定，以土地使用权为条件与其他单位或个人合建房屋的，根据批准文件、合建协议或者投资数额确定土地使用权。
2．如果B单位委托土地登记代理机构代理申请该宗地土地登记，该机构应按以下步骤办理：
(1)接洽了解B单位产权情况。
(2)明确委托代理事宜。
(3)收集资料：
1)土地登记申请书；
2)B单位法人代表身份证明书；
3)土地登记代理委托书及代理人身份证明；
4)土地登记代理人资格证书；
5)土地部门的建设用地批准书；
6)土地红线图；
7)宗地图。
(4)核实权属来源资料(对申请人、用地合法性、用途、面积、使用权类型等的审核)。
(5)向土地管理部门提交设定申请材料。
3．填写下表B单位《土地登记申请书》的部分内容。