位于厦门的甲公司与位于台北的乙公司因货物买卖产生纠纷，双方在台湾地区的有关法院就该纠纷进行诉讼，该法院于2010年1月作出终审判决。根据最高人民法院关于人民法院认可台湾地区有关法院民事判决的相关司法解释，下列哪些选项是正确的?
A.当事人可在该判决生效后两年内向人民法院提出对该判决的认可申请
B.申请人向两个个以上有管辖权的中级人民法院申请认可的，由最先立案的中级人民法院管辖
C.乙公司向人民法院提出认可申请后，甲公司向人民法院就同一案件事实提起诉讼的，人民法院应予受理
D.人民法院可以“案件系人民法院专属管辖”为由拒绝认可台湾地区法院的民事判决
参考答案：A, B, D
解析：
最高人民法院关于认可台湾地区的民事判决问题分别在1998年和2009年出台了两个司法解释：《关于人民法院认可台湾地区有关法院民事判决的规定》(以下本题中简称“1998年《规定》”)和《关于人民法院认可台湾地区有关法院民事判决的补充规定》(以下本题中简称“2009年《补充规定》”)，目前两个司法解释同时适用。
1998年《规定》第17条规定：“嗥请认可台湾地区有关法院民事判决的，应当在该判决发生效力后一年内提出。”而后2009年《补充规定》对之进行了修改，2009年《补充规定》第9条第1款规定：“申请认可台湾地区有关法院民事判决的，应当在该判决效力确定后二年内提出。”故A项正确。
2009年《补充规定》第3条第1款规定：“申请人向两个以上有管辖权的中级人民法院申请认可的，由最先立案的中级人民法院管辖。”故B项正确;
1998年《规定》第12条规定：“人民法院受理认可台湾地区有关法院民事判决的申请后，对当事人就同一案件事实起诉的，不予受理。”故C项错误;第9条规定：“台湾地区有关法院的民事判决具有下列情形之一的。裁定不予认可：(三)案件系人民法院专属管辖的……”故D项正确。