参考答案：输入输出子系统。

解析：Windows 98中的文件管理系统可以分成若干相对独立的部分，形成层次结构，以便对不同文件系统的支持，称为“可安装的文件系统”(IFS)。IFS分成三层：第一层是可安装的文件系统管理器，负责主管各种文件系统；第二层是各种文件系统，包含各种不同文件系统的管理程序模块；第三层是输入/输出子系统，功能是支持即插即用，支持小端口驱动程序等功能。