参考答案：A, B, E

解析：申请土地注销登记的情形有：依法收回的国有土地的；依法征收农民集体土地的；因人民法院、仲裁机构的生效法律文书致使原土地权利消失的；当事人为办理注销登记的；因自然灾害等原因造成土地权利消灭的；非住宅国有建设用地使用权期限届满，国有建设用地使用权人未申请续期或者申请续期未获准的。