参考答案：我国在水源地保护工作中主要存在以下三方面的问题：一是水源意识不足。无论是普通民众还是相关管理部门，都存在着水源地保护意识不够的问题，导致生活污水、工业污水随意排放，违规旅游项目胡乱开发。二是执法监管力度不够。由于管理人员不足、地理位置限制以及部分管理人员与非法排污企业相勾结，导致相关部门监管不力、执法不严，相关的法律法规成一纸空文。三是协调利益的机制不成熟。由于管理协调机制尚不完善，水源地上下游利益分配机制、补偿机制不规范，缺乏统一成熟的机制样本等原因，导致我国的水源地保护工作陷入两难困境。