A、分子、原子不带电，离子带电，认识错误，故A错误；

B、分子、原子、离子都是构成物质的基本粒子，故B正确；

C、原子是化学变化中的最小的粒子，所以“都是”化学变化中的最小的粒子，认识错误，故C错误；

D、分子不一定比原子、离子大，认识错误，故D错误．

故选B．