参考答案：C,D,E

解析：PCR法可以直接检测衣原体的核酸，酶免法检测抗原可检测临床标本中的可溶性抗原，可利用抗LPS单抗进行直接法荧光抗体染色检测上皮细胞内的衣原体抗原。