参考答案：B,C,E

解析： 铁路运输企业收取的占用邮车容积使用费按照“交通运输业”缴纳营业税，所以A选项错误；铁路运费企业收取的退票费收入属于运输收入中的其它收入，应按“交通运输业”计征营业税；运输企业收取的铁路码头使用费属于货运其他收入，按照“交通运输业”计征营业税；民航部门收取的地而服务费，按照“交通运输业”计征营业税，所以D选项错误；水运部门收取的停泊费按照“交通运输业”计征营业税。