广州市越秀区的瑞尔商店2009年9月1日领取营业执照开业，主要零售影碟。同年12月31日经税务机关检查：瑞尔商店未按规定办理税务登记，成本费用记录较真实，共计24万元，但账簿设置不健全，收入总额无法核实。
[要求] 根据会计法规和税收征管法规回答下列问题：

瑞尔商店是合法经营吗请说明理由。