参考答案：(1)岛屿生物地理学平衡理沦：R.H.MacArthur和E.D.Wilson(1967)阐述了岛屿上物种的数目与面积之间的关系。岛屿生物种类的丰富程度完全取决于两个过程，即新物种的迁入和原来占据岛屿物种的灭绝，当迁入率和灭绝率相等时，岛屿物种数达到动态的平衡状态，即物种的数目相对稳定，但物种的组成却不断变化和更新，这就是岛屿生物地理学理论的核心，所以岛屿生物地理学理论也称为平衡理论。
(2)岛屿生态理论对自然保护区的设计具有指导意义：①保护区地点的选择。②保护区的面积，即按平衡假说，保护区面积越大，对生物多样性保育越有利。此外，保护区周围的生态系统与保护区的相似也是保护区确定面积时要考虑的。如果保护区被周围相似的生态系统所包围，其面积可以小一些；反之，则适当增加保护区面积。③保护区的形状。保护区的最佳形状是圆形，应避免狭长形的保护区。主要是因为考虑到边缘效应，狭长保护区不如圆形的好。另外，狭长形的保护区造价高，保护区也易于受人为的影响。④一个大的保护区比几个小保护区好。这是因为大的岛屿含有更多的物种。由于保护区的隔离作用，保护区的物种数可能超出保护区的承载力，从而使有些物种灭绝。⑤保护区之间的连接和廊道：一般认为，几个保护区通过廊道连接起来，要比几个相互隔离的保护区好。这是因为，物种可以廊道为踏脚石岛，不断地进入保护区内，从而补充局部的物种灭绝。⑥景观的保护：对于保护区的建立，大多数的研究主要考虑遗传多样性和物种多样性，而忽视了更高水平的保护。