参考答案：(1)蛋白质组学的研究意义。传统的蛋白质研究仅注重研究单一蛋白质，无法满足后基因组时代的要求。这是因为：①各种生理现象及生命活动的发生受多因素影响，必然涉及多个(种)蛋白质分子；②多个蛋白质的参与是交织成网络的，或平行发生，或呈级联因果；③在执行生理功能时，蛋白质的表现是多样的、动态的，并不像基因组那样基本固定不变。而蛋白质组学注重研究参与特定生理或病理状态的所有蛋白质种类及其与周围环境(分子)的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。可以说蛋白质组学研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑，也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一。正如中科院院士邹承鲁教授所言：“蛋白质研究的第三个黄金时代已经来临。以蛋白质折替、蛋白质空间结构以及借在研究生物体所包含的全部蛋白质及其相互作用的蛋白质组学，已经成为蛋白质科学，甚至整个生命科学中最为活跃的前沿领域。”(2)蛋白质组学发展趋势。①在基础研究方面，蛋白质组学研究技术已被应用到生命科学的诸多领域，如细胞生物学、神经生物学等。在研究对象上，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围，涉及各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。在未来的发展中，蛋白质组学的研究领域将更加广泛。②在应用研究方面，蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。在对癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景，目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。③在技术发展方面，蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存，各有优势和局限的特点，而难以像基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外，更强调各种方法间的整合和互补，以适应不同蛋白质的不同特征。另外，蛋白质组学与其他学科的交叉也将日益显著和重要，这种交叉是新技术、新方法的活水之源，特别是，蛋白质组学与其他大规模科学如基因组学，生物信息学等领域的交叉，所呈现出的系统生物学(system biology)研究模式，将成为未来生命科学最令人激动的新前沿。