参考答案：D

解析：[知识点] 中级人民法院管辖的一审民事案件
本题考察的重点是只能由中级以上人民法院管辖的案件。《最高人民法院关于审理商标案件有关管辖和法律适用范围问题的解释》第二条第二款、第三款规定：“商标民事纠纷第一审案件，由中级以上人民法院管辖。各高级人民法院根据本辖区的实际情况，经最高人民法院批准，可以在较大城市确定1—2个基层人民法院受理第一审商标民事纠纷案件。”可见，某些基层人民法院可以受理第一审商标民事纠纷案件，所以A选项错误。《民事诉讼法》第十九条规定：“中级人民法院管辖下列第一审民事案件：(一)重大涉外案件；(二)在本辖区有重大影响的案件；(三)最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件。”可见，并不是所有涉外案件均由中级人民法院管辖，只有重大涉外案件才由其管辖，所以，B选项错误。根据《最高人民法院关于审理著作权民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第二条的规定，著作权民事纠纷案件，由中级以上人民法院管辖。各高级人民法院根据本辖区的实际情况，可以确定若干基层人民法院管辖第一审著作权民事纠纷案件。所以，C选项错误。根据《最高人民法院关于适用(中华人民共和国民事诉讼法>若干问题的意见》第二条第一款的规定，专利纠纷案件由最高人民法院确定的中级人民法院管辖。所以，D选项正确。
综上，本题答案为：D。