参考答案：

在真核生物中，不同的基因是由不同的RNA聚合酶转录的，其中RNA聚合酶Ⅲ负责转录5S rRNA、tRNA等小分子RNA，但它不转录分子质量不大的5.8S rRNA。RNA聚合酶Ⅰ转录5.8S rRNA，其原因在于：

(1)RNA聚合酶Ⅰ和RNA聚合酶Ⅲ识别的启动子不同。转录5S rRNA的RNA聚合酶Ⅲ能识别位于转录区内的启动子，即内部启动子。而转录5.8S rRNA的RNA聚合酶Ⅰ能识别的启动子分为两部分：-40～+5为近启动子，其功能决定起始转录的精确位置；-165～-40称为远启动子，其功能影响转录的频率。

(2)RNA聚合酶Ⅲ负责转录5S rRNA等小分子RNA，而RNA聚合酶Ⅰ负责转录的5.8S rRNA，则是与18S和28S一起，先转录成一个大的前体分子，经转录后处理，成为成熟的5.8S rRNA。

(3)5S rRNA基因与主体rRNA基因(由5.8S、18S、28S rRNA基因一起构成)的组织形式不同，5S rRNA基因拷贝数很多，没有基因扩增现象，而主体rRNA基因往往存在基因扩增现象。