甲公司拥有一块国有土地使用权，经会计师事务所评估价值为1000万元。2010年5月，甲公司与乙公司签订了一份土地使用权转让合同，乙公司以1000万元的价款受让甲公司的国有土地使用权。同年7月，甲公司和乙公司经协商后约定：(1)由于乙公司为甲公司向数家银行的贷款提供了担保，总额260万元(其中50万元因为甲公司到期未能偿还，已经由乙公司代其偿还，其余债务尚未到期)，该260万元的债务应当在土地使用权转让费中抵销；(2)甲公司与乙公司曾共同投资200万元(各投资100万元)成立一有限责任公司，现该公司因经营不善而严重亏损，乙公司要求甲公司负担其100万元投资款的返还，甲公司同意，该100万元也从土地转让费中扣除；(3)甲公司系于2009年3月由一家集体企业进行公司改制而来，改制后乙公司和甲公司的上级主管部门签订了承包经营合同，由乙公司对甲公司进行承包经营，现乙公司提出，由于其接管了甲公司50名员工，按每人每年6000元工资，每人工作20年计算，乙公司需支付600万元工资，该项支出也应从土地使用权的转让费中扣除。
以上各项抵销后，乙公司需要向甲公司支付40万元的土地使用权转让费，甲公司现欠银行贷款400万元未能偿还，该银行知道该情况后，认为甲公司以40万元转让土地使用权，影响了甲公司的偿还能力，但又不知道如何是好。
问：如果你是该银行的法律顾问，你能够提供何种法律意见以保护其合法权益
