呼吸系统包括呼吸道和肺两部分．呼吸道的组成由上到下依次是鼻腔、咽、喉、气管和支气管，外界的空气进入肺依次经过鼻腔、咽、喉、气管和支气管，最后进入肺，在肺里完成气体交换．鼻腔内有鼻毛，可以阻挡灰尘，呼吸道都有骨或软骨做支架，其内表面覆盖着黏膜，黏膜内还分布有丰富的毛细血管．这些特点既保证了气体的畅通，又对吸入的空气具有清洁、温暖和湿润的作用；肺是气体交换的场所，是呼吸系统的主要器官．据此可知，肺结核的致病微生物从外界到达发病部位的正确路线是：鼻腔、咽、喉、气管、支气管和肺．可见D符合题意．

故选：D