参考答案：B

解析：动物疫情的认定主体：动物疫情由县级以上人民政府兽医主管部门认定，其中重大动物疫情由省、自治区、直辖市人民政府兽医主管部门认定，必要时报国务院兽医主管部门认定。因此，动物疫情的认定主体是兽医主管部门。故答案选择B。