参考答案：

(1)监理工程师不同意接受施工单位的索赔要求，因为不符合一般索赔程序的常规。通常，施工单位应当在索赔事件发生后的28天内，向监理工程师递交索赔意向通知，表示索赔的愿望和要求。如果超过这个期限，监理工程师和业主有权拒绝索赔要求。本工程的施工单位在竣工结算时才提出该项索赔要求，显然已超过索赔的有效期限。

(2)索赔程序通常可按以下步骤进行。

①在索赔事件发生后的28天内，施工单位向监理工程师提交索赔意向通知，表达索赔要求。

②索赔准备。在索赔事件发生后，提交索赔报告前，应进行以下主要的准备工作：对索赔事件进行调查、了解；损害事件原因分析；明确索赔根据及理由；损失调查；收集证据；起草索赔报告。

③提交索赔报告。在索赔意向通知提交后的28天内(或监理工程师可能同意的合理时间内)承包商应递交正式的索赔报告。报告中应包括：事件发生的原因、有关权益影响的证据资料、索赔依据、索赔要求的经济补偿和工期延长的详细计算等。

④监理工程师审查索赔报告。

⑤监理工程师与承包商协商补偿达成共识。

⑥监理工程师对索赔的处理决定。

⑦业主审查索赔处理。

⑧承包商对最终索赔处理的决定。

(3)监理工程师对所提索赔额的处理意见如下。

①由于业主图纸延误造成的人工窝工及机械闲置费用损失，应给予补偿。但原计算方法不当。人工费不应按工日计算，机械费用不应按台班费计算，而应按人工及机械的闲置费(机械折旧费或租赁费)计算。若人工或机械调做其他工作，可考虑生产效率下降而导致增加的费用。

②管理费的计算(公司管理及现场管理费)不能以合同总价为基数乘以相应费率，而应以直接费用为基数乘以费率来计算。

③利润已包括在各项工程内容的价格内，除工程范围变更和施工条件变化引起的索赔可考虑利润补偿外，由于延误工期并未削减某项工作的实施而导致利润减少，故不应再给予利润补偿。

④由于提高基础混凝土强度而导致的费用增加，是属于施工单位本身所采取的技术措施，不是业主方的要求，也不是设计、合同及规范的要求，所以这部分费用应由施工单位自行承担。

(4)监理工程师做出的索赔处理决定不是终局性的，对业主和承包商都不具有强制性的约束力。如果任何一方认为该处理决定不公正，都可提请监理工程师重新考虑，或向监理工程师提供进一步证明，要求监理工程师进行适当的修改、补充或让步。如监理工程师仍坚持原决定或承包商对新的决定仍不同意，可按合同中有关条款提请仲裁。