A、用力捏小皮球，球变瘪了，是手的作用力使球变瘪，不是利用了大气压，故A错误．

B、篮球撞击在篮板上被弹回，是篮板的弹力使篮球弹回，与大气压无关，故B错误．

C、茶壶盖上的小孔将壶内外的空气接通起来，使内外气压平衡，水才能顺利倒出来，是大气压的应用，故C正确．

D、把药液射进肌肉里，是注射器活塞的压力使药液进入肌肉，大气压无关，故D错误．

故选C．