参考答案：

“现代城市运行中的脆弱性”在S市中特别重大火灾中的具体表现有：

①大楼维修无证且违章作业，“安全网”不能阻燃；

②无法有效发挥消防云梯和设施的高空消防灭火和救援的功能；

③市民缺乏自救意识、保险意识和应急疏散能力；

④政府对建筑工程监督不到位，未能有效动员民众；

⑤建设投入不足，安全设施和管理措施不到位，建筑设计不合理。