“上海终于来到我的身旁”，这句话描述的含义是说“上海在运动”，据此我们再来逐一分析每一选项．

A、上海不能相对于自己运动，所以错误；

B、上海与青岛之间的相对位置也不会发生变化，所以错误；

C、如果另一艘船与该船交会，上海相对于另一艘船应该是远离，而不是“来到身旁”，所以错误；

D、以他坐的轮船为参照物，上海与他的相对位置在靠近，所以符合“上海终于来到我的身旁”的说法，所以正确．

故选D．