（1）月亮躲进云里，被研究的物体是月亮，月亮躲进云里，说明月亮是运动的，云和月亮之间发生了位置的改变，所以选择云为参照物；

（2）坐在车里的人，看见路边树木向后运动，是车和树木的位置发生了改变，因此选择的是车或者自己为参照物．

故答案为：云；车（或自己）．