物理性消化指的是物质的本质在消化前后没有变化，只是大小、形状、位置发生变化；化学性消化指的是食物在消化酶的作用下进行的消化，即物质本身发生了变化，变成了其他的物质．蛋白质在口腔内不能被消化，到了胃中胃蛋白酶的作用下被初步消化成氨基酸，然后在小肠内被肠液和胰液中的消化酶的作用下被最终消化成氨基酸，所以蛋白质进行化学性消化的场所是胃和小肠．

故选：D