A、小肠是消化食物和吸收营养物质的主要场所，大肠只能吸收少量的水、无机盐和维生素，对食物没有消化作用，也不是吸收营养物质的主要场所；故符合题意．

B、人体具有免疫功能，但免疫并不是总对人体有益的，例如在进行器官移植时，患者的免疫系统会对异体器官产生排斥．故不符合题意．

C、化石是指保存在岩层中地质历史时期的古生物遗物和生活遗迹．不同生物化石的出现和地层的形成，有着平行的关系，也就是说，在越古老的地层中，挖掘出的化石所代表的生物，结构越简单，分类地位越低等．在距今越近的地层中，挖掘出的化石所代表的生物，结构越复杂，分类地位越高等．故不符合题意．

D、细菌和真菌在结构上的区别是细菌的细胞里没有成型的细胞核，只有遗传物质集中的区域，真菌的细胞里具有细胞核，酵母菌是单细胞的真菌；故不符合题意．

故选：A